본문 바로가기

김미연

[취향저격 분자진단] PCR, 넌 어디까지 알고 있니?(바이오마이크로시스템연구단 김미연 기자) PCR, 넌 어디까지 알고 있니? PCR(polymer chain reaction)은 원하는 DNA의 sequence를 통해 다량의 DNA를 증폭하는 기술이다. Denaturation, Annealing, Extension의 세 단계로 구성되어 있고, 이 과정이 반복되면서 DNA가 증폭된다. 기본적으로 DNA template, primer, dNTP, polymerase등으로 구성되어 진행된다. 오늘은 유전자를 증폭시키는 PCR의 여러 가지 종류를 파헤쳐 보고자 한다. 1) RT-PCR(Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction) 특정 부위의 RNA를 template로 하여 이에 상응하는 cDNA(complementary DNA)를 합성한 뒤, PCR 증폭을 시.. 더보기
[취향저격 분자진단] NGS를 응용한 sequencing 방법(바이오마이크로시스템연구단 김미연) NGS를 응용한 sequencing 방법 NGS(Next-generation sequencing)의 비약적인 발전으로 레퍼런스 염기서열이 없이 분석이 가능한 de novo sequencing, 유전자 발현 변화를 볼 수 있는 transcriptome profiling, 코딩 영역만 해독하는 엑솜시퀀싱 및 질병의 진행 여부 연구까지 NGS가 있어 가능해졌다. 이번 기사에서는 NGS를 응용한 sequencing 방법들에 대해 이야기해보고자 한다. (1) Resequencing Resequencing은 이미 레퍼런스 유전체가 완성된 생물종의 다양한 유전체를 분석하고 그 서열을 레퍼런스와 비교함으로써 특정 유전체 내 SNP 등의 변이를 발굴하고자 할 때 주로 쓰인다. NGS가 가장 널리 활용되고 있는 분야이며 .. 더보기
[취향저격 분자진단] NGS: sequencing이란 무엇인가?(바이오마이크로시스템연구단 김미연 기자) NGS: sequencing이란 무엇인가? 최근 차세대 염기서열 분석법(Next Generation Sequencing: NGS) 기술의 발달과 분석 비용의 하락으로 인해 질병 원인 유전자 분석 연구 외의 다양한 연구 분야에서 NGS가 보편적으로 활용되고 있으며, 의료계 및 산업계에서도 활발하게 사용되어지고 있다. 차세대 염기서열 분석법 이전, 사람의 몸을 구성하고 있는 DNA 서열을 모두 알고자 했던 과학자들은 DNA sequencing 기술을 연구했다. DNA sequencing 기술은 생화학적 방법으로 생명체의 모든 세포의 DNA 사슬을 구성하는 염기 A, T, G, C가 결합된 서열 순서를 분석하는 기술이다. 가장 원초적인 방법으로 Maxam-Gilbert법과 효소적인 방법인 Sanger법이 있다.. 더보기
[취향저격 분자진단] 혈액을 떠다니는 DNA (김미연 기자) 혈액을 떠다니는 DNA ‘피’라고 불리는 혈액은 몸 안의 세포에 산소와 영양소를 공급하고 세포의 신진대사에 의해 발생하는 이산화탄소와 노폐물을 회수하여 운반하는 체액이다. 혈액은 결합 조직의 한 종류로 고체 성분의 혈구와 액체 성분의 혈장으로 구성되어있다. 혈구는 혈소판과 백혈구, 적혈구로 이루어져 있으며 혈장은 섬유소원과 혈청으로 구성되어있다. 우리 눈에 빨간 액체로만 보이는 혈액은 상당히 많은 물질들로 구성되어있고, 전문의들에게 다양한 의학적 정보들을 제공해준다. 특히 혈액검사는 의료 행위 중 질병 유무, 의약품의 효과, 무기질 영양상태, 생화학 및 생리적 상태를 검사하는 등 다양한 분야에 활용되고 있다. 이러한 혈액검사방법의 발전은 ‘피 한 방울로 난치병 진단이 가능하다면 얼마나 좋을까?’라는 생각.. 더보기